咖啡因是咖啡中的提神成分。一般建议在计划入睡前至少5小时停止饮用咖啡。

然而，不同的人对咖啡因的耐受程度有差异，本身存在失眠或睡眠障碍的人群，应尽量少喝或不喝咖啡。

饮用咖啡后出现心跳加快属常见现象，但对于本身已有心律失常的人群，则需引起重视。心律失常指心脏电传导异常导致的心跳不规律，包括心跳过快、过慢或不规则。医生建议有心悸或心律失常的患者限制或减少咖啡因摄入。

咖啡会刺激胃部分泌更多胃酸。如果本身患有胃溃疡、胃酸过多或胃食管反流的人群，经常或过量饮用咖啡可能会导致恶心、呕吐、胃反酸、烧心等症状。

肠易激综合征是常见的功能性肠病，患者可能会频繁腹泻、便秘。此类人群对咖啡因比较敏感，可能会加重胃肠不适、腹泻的症状。

健康人群不用担心喝咖啡会导致骨质疏松。不过，对于已经患有骨质疏松的人群，《老年骨质疏松性疼痛诊疗与管理中国专家共识（2024版）》中建议应当避免过量饮用咖啡。

青光眼患者在日常生活中应避免饮用咖啡这类高含量咖啡因的饮品，避免眼压升高及波动对眼睛进一步造成伤害。

《中国儿童青少年零食指南（2018）》提到：含有咖啡因成分的食物对儿童大脑发育和功能都会产生负面影响。因此12岁及以下儿童不喝浓茶、咖啡等含咖啡因的饮料。